学校创建于1938年，历经贵州省立毕节师范学校、毕节半耕半读师范学校、毕节师范专科学校等时期。1993年，教育部定名为毕节师范高等专科学校。2005年3月，毕节师范高等专科学校与毕节教育学院合并组建毕节学院，成为全日制普通本科高等学校。2014年5月，经教育部批准，毕节学院更名为贵州工程应用技术学院。
学校占地面积1300余亩，教学科研仪器设备总值超过1.2个亿，纸质图书103.38万册，电子图书128.24万册，中外文数据库20个；学校设有13个教学学院、1个教学部、52个本科专业，涵盖工学、理学、教育学、文学、管理学、艺术学等9个学科门类；有来自全国15个省、区、市的全日制在校生11578人；有教职工879人，其中博士78人、硕士394人、正高职称74人、副高职称284人；设有1个院士工作站。