这两个句式,在表达"建议"时,是一样的意思.既"(你)为什么不做.....?",或"(你)应该做.....".如：
1、Why don't you turn to the reference book?
2、Why not turn to the reference book?
"(你)为什么不看参考书呢?"也就是"你应该看一下参考书".
但是Why don't you do还可以作为一个疑问句使用,提出疑问.如：
Why didn't you see the football match?
"你为什么没有看这场足球赛?"