湖北医药学院成立于1965年，原名武汉医学院郧阳分院，1977年开始普通本科教育，1986年更名为同济医科大学郧阳医学院，1994年独立设置定名为郧阳医学院，1995年开始联合培养硕士研究生；2010年经教育部批准更名为湖北医药学院。
2013年被国务院学位委员会批准为硕士学位授予单位，同年开始办研究生层次留学生教育；2017年10月，学校在深圳创建临床学院，深圳坪山医院成为湖北医药学院第八临床学院。
在学科建设方面，湖北医药学院据2019年1月学校官网显示，该校有一级学科硕士点4个、专业学位硕士授权点5个、省级重点一级学科3个、“楚天学者计划”设岗学科8个。该校有国家特色建设专业2个、省级本科品牌专业5个、省级精品课程7门、省级教学示范中心3个。